• ফেসবুক
  • লিঙ্কডইন
  • ইউটিউব

তিনটি অক্ষর SNP জনসংখ্যার জেনেটিক্সের গবেষণায় সর্বব্যাপী।মানুষের রোগ গবেষণা, ফসলের বৈশিষ্ট্যের অবস্থান, প্রাণীর বিবর্তন এবং আণবিক বাস্তুবিদ্যা নির্বিশেষে, ভিত্তি হিসাবে SNPs প্রয়োজন।যাইহোক, যদি আপনার উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং-এর উপর ভিত্তি করে আধুনিক জেনেটিক্স সম্পর্কে গভীর ধারণা না থাকে এবং এই তিনটি অক্ষরের মুখোমুখি হলে, এটি "সবচেয়ে পরিচিত অপরিচিত" বলে মনে হয়, তাহলে আপনি পরবর্তী গবেষণা চালাতে পারবেন না।সুতরাং ফলো-আপ গবেষণা শুরু করার আগে, এসএনপি কী তা একবার দেখে নেওয়া যাক।

SNP (একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম), আমরা এর সম্পূর্ণ ইংরেজি নাম থেকে দেখতে পাচ্ছি, এটি একক নিউক্লিওটাইড প্রকরণ বা পলিমরফিজমকে বোঝায়।এটির একটি আলাদা নামও রয়েছে, যার নাম SNV (একক নিউক্লিওটাইড প্রকরণ)।কিছু মানব গবেষণায়, শুধুমাত্র যাদের জনসংখ্যার ফ্রিকোয়েন্সি 1% এর বেশি তাদের এসএনপি বলা হয়, তবে ব্যাপকভাবে বলতে গেলে, দুটিকে মিশ্রিত করা যেতে পারে।তাই আমরা বলতে পারি যে SNP, একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম, সেই মিউটেশনকে বোঝায় যেখানে জিনোমের একটি নিউক্লিওটাইড অন্য নিউক্লিওটাইড দ্বারা প্রতিস্থাপিত হয়।উদাহরণস্বরূপ, নীচের চিত্রে, একটি AT বেস পেয়ারকে একটি GC বেস পেয়ার দিয়ে প্রতিস্থাপিত করা হয়েছে, যা একটি SNP সাইট।

ছবি

জেনেটিক্স ১

যাইহোক, এটি একটি "একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম" বা "একক নিউক্লিওটাইড বৈচিত্র্য" হোক না কেন, এটি তুলনামূলকভাবে বলা যায়, তাই SNP ডেটার ভিত্তি হিসাবে জিনোম রিকোয়েন্সিং প্রয়োজন, অর্থাৎ, ব্যক্তির জিনোম সিকোয়েন্স করার পরে সিকোয়েন্সিং ডেটা সিকোয়েন্স করা হয়।জিনোমের তুলনায়, যে সাইটটি জিনোম থেকে আলাদা তা একটি SNP সাইট হিসাবে সনাক্ত করা হয়।

শাকসবজিতে SNP এর পরিপ্রেক্ষিতে,প্ল্যান্ট ডাইরেক্ট পিসিআর কিটদ্রুত সনাক্তকরণের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে।

মিউটেশন প্রকারের পরিপ্রেক্ষিতে, SNP-এ রূপান্তর এবং রূপান্তর অন্তর্ভুক্ত।ট্রানজিশন বলতে পিউরিনের সাথে পিউরিন বা পিরিমিডিনকে পাইরিমিডিন দিয়ে প্রতিস্থাপনকে বোঝায়।রূপান্তর বলতে পিউরিন এবং পাইরিমিডিনগুলির মধ্যে পারস্পরিক প্রতিস্থাপনকে বোঝায়।সংঘটনের ফ্রিকোয়েন্সি ভিন্ন হবে, এবং রূপান্তরের সম্ভাবনা ট্রান্সভার্সনের চেয়ে বেশি হবে।

যেখানে SNP ঘটে তার পরিপ্রেক্ষিতে, বিভিন্ন SNP-এর জিনোমে ভিন্ন ভিন্ন প্রভাব থাকবে।SNPs যেগুলি আন্তঃজেনিক অঞ্চলে ঘটে, অর্থাৎ, জিনোমের জিনের মধ্যবর্তী অঞ্চল, জিনোমের কার্যকারিতাকে প্রভাবিত করতে পারে না এবং জিনের ইন্ট্রন বা আপস্ট্রিম প্রবর্তক অঞ্চলে মিউটেশনগুলি জিনের উপর একটি নির্দিষ্ট প্রভাব ফেলতে পারে;এনকোডেড অ্যামিনো অ্যাসিডের পরিবর্তন ঘটায় কিনা তার উপর নির্ভর করে জিনের এক্সন অঞ্চলে যে মিউটেশনগুলি ঘটে তা জিনের কার্যকারিতার উপর বিভিন্ন প্রভাব ফেলে।(অবশ্যই, এমনকি যদি দুটি SNP অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে পার্থক্য সৃষ্টি করে, তবে তাদের প্রোটিনের গঠনের উপর ভিন্ন প্রভাব রয়েছে এবং শেষ পর্যন্ত জৈবিক ফেনোটাইপের উপর প্রভাবগুলি বেশ ভিন্ন হতে পারে)।

যাইহোক, জিনের অবস্থানে যে SNPগুলি ঘটে তা সাধারণত নন-জিন অবস্থানের তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে কম হয়, কারণ একটি SNP যেটি একটি জিনের কার্যকারিতাকে প্রভাবিত করে তা সাধারণত ব্যক্তির বেঁচে থাকার উপর নেতিবাচক প্রভাব ফেলে, যার ফলে এই SNP বহনকারী ব্যক্তি তাদের মধ্যে থেকে বাদ দেওয়া হয়।

অবশ্যই, ডিপ্লয়েড জীবের জন্য, ক্রোমোজোম জোড়ায় জোড়ায় বিদ্যমান, তবে প্রতিটি বেসের জন্য এক জোড়া ক্রোমোজোমের জন্য ঠিক একই হওয়া অসম্ভব।অতএব, কিছু SNP-গুলিও হেটেরোজাইগাস দেখাবে, অর্থাৎ, ক্রোমোজোমের এই অবস্থানে দুটি ঘাঁটি রয়েছে।একটি গোষ্ঠীতে, বিভিন্ন ব্যক্তির এসএনপি জিনোটাইপগুলি একসাথে একত্রিত করা হয়, যা পরবর্তী বেশিরভাগ বিশ্লেষণের ভিত্তি হয়ে ওঠে।বৈশিষ্ট্যের সংমিশ্রণে, এটি বিচার করা যেতে পারে যে আণবিক চিহ্নিতকারী হিসাবে SNP বৈশিষ্ট্যের সাথে যুক্ত কিনা, বৈশিষ্ট্যের QTL (পরিমাণগত বৈশিষ্ট্য লোকাস) বিচার করা যেতে পারে এবং GWAS (জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি) বা জেনেটিক মানচিত্র নির্মাণ করা যেতে পারে;SNP একটি আণবিক চিহ্নিতকারী হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে ব্যক্তিদের মধ্যে বিবর্তনীয় সম্পর্ক বিচার করুন;আপনি কার্যকরী SNP স্ক্রিন করতে পারেন এবং রোগ-সম্পর্কিত মিউটেশন অধ্যয়ন করতে পারেন;আপনি জিনোমের নির্বাচিত অঞ্চলগুলি নির্ধারণ করতে SNP অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সি পরিবর্তন বা ভিন্নধর্মী হার এবং অন্যান্য সূচকগুলি ব্যবহার করতে পারেন... ইত্যাদি, বর্তমানের সাথে মিলিত উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংয়ের বিকাশের সাথে, সিকোয়েন্সিং ডেটার সেট থেকে কয়েক হাজার বা তার বেশি SNP সাইট প্রাপ্ত করা যেতে পারে।এটা বলা যেতে পারে যে SNP এখন জনসংখ্যার জেনেটিক গবেষণার ভিত্তি হয়ে উঠেছে।

অবশ্যই, জিনোমের ঘাঁটির পরিবর্তনগুলি সর্বদা একটি বেসের সাথে অন্যটির প্রতিস্থাপন হয় না (যদিও এটি সবচেয়ে সাধারণ)।এটাও সম্ভব যে এক বা কয়েকটি ঘাঁটি অনুপস্থিত, বা দুটি ঘাঁটি।মাঝখানে আরও বেশ কয়েকটি ঘাঁটি ঢোকানো হয়েছিল।সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলার এই ছোট পরিসরকে সম্মিলিতভাবে InDel (সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলা) বলা হয়, যা বিশেষভাবে ছোট টুকরো (এক বা একাধিক ঘাঁটি) সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলাকে বোঝায়।একটি জিনের অবস্থানে ঘটে যাওয়া InDel জিনের কার্যকারিতার উপরও প্রভাব ফেলতে পারে, তাই কখনও কখনও InDel গবেষণায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করতে পারে।কিন্তু সামগ্রিকভাবে, জনসংখ্যার জেনেটিক্সের ভিত্তি হিসাবে SNP-এর অবস্থা এখনও অটুট।


পোস্টের সময়: আগস্ট-27-2021