• ফেসবুক
  • লিঙ্কডইন
  • ইউটিউব

আমেরিকান পণ্ডিত এরিক এস. ল্যান্ডার 1996 সালে আনুষ্ঠানিকভাবে একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (SNP) তৃতীয় প্রজন্মের আণবিক চিহ্নিতকারী হিসাবে প্রস্তাব করার পরে, SNP ব্যাপকভাবে অর্থনৈতিক বৈশিষ্ট্য অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণ, জৈবিক জেনেটিক লিঙ্কেজ মানচিত্র নির্মাণ, এবং মানব প্যাথোজেনিক জিন স্ক্রীনিংয়ে ব্যবহৃত হয়েছে।, রোগের ঝুঁকি নির্ণয় এবং ভবিষ্যদ্বাণী, স্বতন্ত্র ওষুধ স্ক্রীনিং এবং অন্যান্য জৈবিক ও চিকিৎসা গবেষণা ক্ষেত্র।অর্থকরী ফসল প্রজননের ক্ষেত্রে, SNP সনাক্তকরণ প্রয়োজনীয় বৈশিষ্ট্যের প্রাথমিক নির্বাচন উপলব্ধি করতে পারে।এই নির্বাচনের উচ্চ নির্ভুলতার বৈশিষ্ট্য রয়েছে এবং কার্যকরভাবে রূপবিদ্যা এবং পরিবেশগত কারণগুলির হস্তক্ষেপ এড়াতে পারে, যার ফলে প্রজনন প্রক্রিয়াটি ব্যাপকভাবে সংক্ষিপ্ত হয়।অতএব, মৌলিক গবেষণার ক্ষেত্রে SNP একটি বিশাল ভূমিকা পালন করে।

একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম, এসএনপি) সেই ঘটনাকে বোঝায় যে একই বা ভিন্ন প্রজাতির ব্যক্তিদের ডিএনএ ক্রমানুসারে একই অবস্থানে একক নিউক্লিওটাইড পার্থক্য রয়েছে।একটি একক বেসের সন্নিবেশ, মুছে ফেলা, রূপান্তর এবং বিপরীত সমস্ত এই পার্থক্য সৃষ্টি করতে পারে।অতীতে, SNP-এর সংজ্ঞা মিউটেশনের থেকে ভিন্ন ছিল।SNP লোকাস হিসাবে সংজ্ঞায়িত করার জন্য একটি বৈকল্পিক লোকাসের প্রয়োজন হয় যে জনসংখ্যার একটি অ্যালিলের ফ্রিকোয়েন্সি 1% এর বেশি হয়।যাইহোক, আধুনিক জৈবিক তত্ত্বের বিস্তার এবং প্রযুক্তির প্রয়োগের সাথে, অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সি আর SNP-এর সংজ্ঞা সীমিত করার জন্য প্রয়োজনীয় শর্ত নয়।ন্যাশনাল সেন্টার ফর বায়োটেকনোলজি ইনফরমেশন (NCBI) এর অধীনে সিঙ্গেল নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (dbSNP) ডাটাবেসে অন্তর্ভুক্ত একক নিউক্লিওটাইড বৈচিত্র্যের তথ্য অনুসারে, কম-ফ্রিকোয়েন্সি সন্নিবেশ/মুছে ফেলা, মাইক্রোস্যাটেলাইট প্রকরণ ইত্যাদিও অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে।

SNP আণবিক লেবেলিং এবং সনাক্তকরণ 1

মানবদেহে, SNP এর ফ্রিকোয়েন্সি 0.1%।অন্য কথায়, প্রতি 1000 বেস জোড়ায় গড়ে একটি SNP সাইট রয়েছে।যদিও ঘটনার ফ্রিকোয়েন্সি তুলনামূলকভাবে বেশি, তবে সমস্ত SNP সাইটগুলি বৈশিষ্ট্য সম্পর্কিত প্রার্থী চিহ্নিতকারী হতে পারে না।এটি মূলত সেই অবস্থানের সাথে সম্পর্কিত যেখানে SNP ঘটে।

তাত্ত্বিকভাবে, SNP জিনোম সিকোয়েন্সের যেকোনো জায়গায় ঘটতে পারে।কোডিং অঞ্চলে সংঘটিত এসএনপিগুলি সমার্থক মিউটেশন এবং অ-সমার্থক মিউটেশন তৈরি করতে পারে, অর্থাৎ মিউটেশনের আগে এবং পরে অ্যামিনো অ্যাসিড পরিবর্তিত হয় বা পরিবর্তন হয় না।পরিবর্তিত অ্যামিনো অ্যাসিড সাধারণত পেপটাইড চেইন এর মূল কার্যকারিতা হারায় (মিসেন্স মিউটেশন), এবং অনুবাদ বাতিল (ননসেন্স মিউটেশন) হতে পারে।SNPs যা নন-কোডিং অঞ্চলে এবং আন্তঃজেনিক অঞ্চলে ঘটে এমআরএনএ স্প্লিসিং, নন-কোডিং আরএনএ সিকোয়েন্স কম্পোজিশন এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর এবং ডিএনএ-এর বাঁধাই দক্ষতাকে প্রভাবিত করতে পারে।নির্দিষ্ট সম্পর্ক চিত্রে দেখানো হয়েছে:

SNP প্রকার:

SNP আণবিক লেবেলিং এবং সনাক্তকরণ 2

বেশ কিছু সাধারণ SNP টাইপিং পদ্ধতি এবং তাদের তুলনা

বিভিন্ন নীতি অনুসারে, সাধারণ SNP সনাক্তকরণ পদ্ধতিগুলি নিম্নলিখিত বিভাগে বিভক্ত:

সনাক্তকরণ পদ্ধতির শ্রেণীবিন্যাস তুলনা

SNP আণবিক লেবেলিং এবং সনাক্তকরণ3

দ্রষ্টব্য: সারণীতে তালিকাভুক্ত বর্তমানে আরও সাধারণ SNP সনাক্তকরণ পদ্ধতি ব্যবহার করা হয়, অন্যান্য সনাক্তকরণ পদ্ধতি যেমন নির্দিষ্ট সাইট হাইব্রিডাইজেশন (ASPE), নির্দিষ্ট সাইট প্রাইমার এক্সটেনশন (ASPE), একক বেস এক্সটেনশন (SBCE), নির্দিষ্ট সাইট কাটিং (ASC), জিন চিপ প্রযুক্তি, ভর স্পেকট্রোমেট্রি প্রযুক্তি, ইত্যাদি শ্রেণীবদ্ধ এবং তুলনা করা হয়নি।

উপরের কয়েকটি সাধারণ SNP সনাক্তকরণ পদ্ধতিতে নিউক্লিক অ্যাসিড পরিশোধনের খরচ এবং সময় অনিবার্য।যাইহোক, ফোরজিনের সরাসরি পিসিআর প্রযুক্তির উপর ভিত্তি করে সম্পর্কিত কিটগুলি অশুদ্ধ নমুনাগুলিতে সরাসরি পিসিআর বা কিউপিসিআর পরিবর্ধন সম্পাদন করতে পারে, যা SNP সনাক্তকরণে অভূতপূর্ব সুবিধা নিয়ে আসে।

ফোরজিনের সরাসরি পিসিআর সিরিজের পণ্যগুলি সহজভাবে এবং মোটামুটিভাবে নমুনা পরিশোধন পদক্ষেপগুলি বাদ দেয়, যা টেমপ্লেটগুলি প্রস্তুত করার জন্য প্রয়োজনীয় সময় এবং খরচকে ব্যাপকভাবে হ্রাস করে।অনন্য Taq পলিমারেজের চমৎকার পরিবর্ধন ক্ষমতা রয়েছে এবং জটিল পরিবর্ধন পরিবেশ থেকে বিভিন্ন প্রতিরোধক সহ্য করতে পারে।এই বৈশিষ্ট্যগুলি উচ্চ-ফলন বিশিষ্ট নির্দিষ্ট পণ্য প্রাপ্তির জন্য একটি প্রযুক্তিগত গ্যারান্টি প্রদান করে। বিভিন্ন ধরনের নমুনার জন্য ফোরজিন ডাইরেক্ট PCR/qPCR কিট, যেমন: প্রাণীর টিস্যু (ইঁদুর লেজ, জেব্রাফিশ, ইত্যাদি), উদ্ভিদের পাতা, বীজ (পলিস্যাকারাইড এবং পলিফেনল নমুনা সহ) ইত্যাদি।


পোস্টের সময়: জুলাই-২৩-২০২১